Координацију пројеката међународне помоћи за сектор пољопривреде, прехране и руралног развоја у Босни и Херцеговини врши Министарство вањске трговине и економских односа Босне и Херцеговине, Сектор за пољопривреду, прехрану, шумарство и рурални развој.
Министарство вањске трговине и економских односа Босне и Херцеговине редовно организира Састанке информирања донатора и припрема Годишњи извјештај донаторској помоћи који приказује донаторе који су активни у Босни и Херцеговини, те утврђује њихов допринос за сектор у тој години.
Значајну улогу у планирању и координацији пројеката међународне помоћи имаРадна група за планирање и координацију међународне помоћи у сектору пољопривреде, прехране и руралног развоја која је формирана у циљу реализације мјере 1.8. Првог приоритетног подручја Оперативног програма Босне и Херцеговине за пољопривреду, прехрану и рурални развој у БиХ (2008-2011) – Радна група.
Радна група се руководи препорукама из годишњег Извјештаја о напретку Босне и Херцеговине којег припрема Европска комисија, кључним принципима из Париске декларације о дјелотворној помоћи[1], коју је Босна и Херцеговина потврдила 2010. године, стратешким документима Босне и Херцеговине и принципима широког секторског приступа који се примјењује код програмирања у оквиру ЕК Инструмента за претприступну помоћ (ИПА ИИ).
Радну групу чине представници Министарстава пољопривреде, шумарства и водопривреде Републике Српске, Федералног министарство водопривреде и шумарства, Одјела за пољопривреду, шумарство и водопривреду Владе Брчко дистрикта БиХ, Министарства финансија и трезора БиХ, Агенције за сигурност хране БиХ, Управе БиХ за заштиту здравља биља, Канцеларије за ветеринарство БиХ, Канцеларије за хармонизацију и координацију система плаћања, Дирекције за европске интеграције и Агенције за унапређење страних инвестиција БиХ, те представници задружних савеза Босне и Херцеговине, Републике Српске и Федерације Босне и Херцеговине као невладине организације.
Редовне састанке Радне групе и координационе састанке донатора у сектору пољопривреде организира и њима предсједава Министарство вањске трговине и економских односа БиХ.
[1] (1)Власништво, (2) Уклапање, (3) Усклађивање, (4) Управљање усмјерено ка резултатима и (5) Међусобна одговорност