Пољопривредна производња у БиХ још увијек има одлике екстензивне производње и у великој мјери је овисна од временских прилика. Карактеристике пољопривредног сектора су ниска продуктивност, неповољна структура и величина фарми, недовољна и лоша технолошка опремљеност, овисност од увоза углавном свих инпута потребних за производњу како сјеменског материјала, заштитних средстава и минералних ђубрива, тако опреме и пољопривредне механизације. Такођер, резултати анализа показују да пољопривредна производња у БиХ није, а ни у скорој будућности неће бити цјеновно конкурентна, бар док се не повећа њена производност и продуктивност. Додатно, пољопривредни сектор у БиХ у изградњи одрживих конкурентских предности мора усмјерити снаге на унапређење квалитете и производњу посебних (типичних и традиционалних) високо вриједних производа, односно производа са додатом вриједношћу.
Потенцијали пољопривредне производње у БиХ који се огледају у повољним агроклиматским увјетима, великом броју најразличитијих пољопривредних култура, очуваном пољопривредном земљишту, производима изврсне квалитете и традиције, великом броју аутохтоних и изворних производа, традицији, знању и труду пољопривредних произвођача, ипак нису искориштени у потпуности.
Министарство вањске трговине и економских односа БиХ у пољопривредном сектору обавља послове и задатаке из надлежности БиХ који се односе на дефинирање политике, координацију дјелатности и усклађивање планова ентитетских тијела власти и институција на међународном плану.
Управне организације у саставу Министарства вањске трговине и економских односа БиХ су Канцеларија за ветеринарство БиХ која је надлежна за здравље и његу животиња; Управа за заштиту здравља биља БиХ надлежна је за заштиту здравља биља, а Канцеларија за хармонизацију и координацију система плаћања у пољопривреди, исхрани и руралном развоју је надлежна за хармонизацију и координацију система плаћања у пољопривреди, исхрани и руралном развоју.
Како би се осигурао ефективни развој имплементације политике сигурности хране БиХ, Министарство усмјерава и надзирањем радом Канцеларију за ветеринарство БиХ и Управу БиХ за заштиту здравља биља, те координира активности с Агенцијом за сигурност хране БиХ.
Надлежност и управљање пољопривредном производњом у Босни и Херцеговини је на нивоу ентитета и Брчко дистрикта, и то у оквиру институција надлежних за пољопривреду; Министарства пољопривреде, шумарства и водопривреде Републике Српске, Федералног министарства пољопривреде, водопривреде и шумарства и Одјела за пољопривреду, шумарство и водопривреду Брчко дистрикта БиХ. У Федерацији БиХ надлежност у области пољопривреде имају и успостављене управе у свих 10 кантона које су надлежне за питања пољопривреде, ветеринарства, шумарства и водопривреде. Надлежности ентитетских министарстава су: извршавање политика и проведба закона које су усвојила надлежна тијела ентитетских власти, надзор над примјеном прописа и доношење одлука, управљање природним ресурсима за развој пољопривреде, прехрамбене индустрије и пратећих дјелатности и то у области биљне производње, сточарства, руралног развоја, рибарства и лова, заштите и кориштења пољопривредног земљишта, прехрамбене индустрије, производње сточне хране, водопривреде, ветеринарске и фитосанитарне заштите, заштите јавног здравља и шумарства. Рад Одјела за пољопривреду, шумарство и водопривреду БД БиХ везан је за развој и побољшање пољопривредне производње и узгој стоке, заштиту и кориштење пољопривредног земљишта, ветеринарску и санитарну контролу здравља животиња и јавног здравља, примјену кредитне политике, заштите и рационалног кориштења пољопривредног земљишта, пружање савјетодавних услуга у пољопривреди и сточарству, обнављању шума, заштити од недозвољене сјече, одржавању структура за управљање водама.